Modifiche epigenetiche, meno segreti

CRONACA – Sequenziare il Dna è diventata ormai quasi una routine, ma si può andare oltre come hanno fatto i ricercatori dell’Università di Cambridge in collaborazione con il Babraham Institute.

Shankar Balasubramanian del Dipartimento di Chimica e Ricerca sul Cancro e Michael Booth, studente di PhD hanno messo a punto una nuova tecnica che permette di sequenziare due particolari modifiche – “epigenetiche”- che avvengono a livello del Dna nei mammiferi. Queste modifiche regolano l’espressione dei geni, accendendoli e spegnendoli in modo da portare al differenziamento e allo sviluppo delle varie cellule, in diversi tessuti e organi, a partire da un medesimo genoma.

L’epigenetica è una parte della genetica che studia le modifiche (fenotipiche) a livello di DNA, come l’aggiunta di gruppi chimici sulle basi azotate, che non intaccano la sequenza del genoma e sono necessarie per regolare l’espressione dei geni, determinando quali esprimere e quali no in ciascuna cellula. Il risultato è visibile a livello cellulare ed è ciò che permette la differenziazione tra tipi cellulari  appartenenti a diversi tessuti e organi

Prendete gli occhiali e preparatevi al genoma in 3D

CRONACA – Non è una novità assoluta e già da tempo si parla di mappe tridimensionali del genoma, ma finalmente oggi un gruppo di ricercatori francesi è riuscito a ottenere una mappa tridimensionale del genoma della Drosophila con una risoluzione mai raggiunta fino ad ora.

Dopo la notizia del genoma a 1000 dollari, la ricerca apparsa sulle pagine di Cell mette in luce un aspetto del funzionamento del DNA: la sua organizzazione spaziale dentro il nucleo della cellula. L’espressione genica infatti è il risultato non solo della sequenza nucleotidica ma anche dell’organizzazione spaziale che il DNA ha nel nucleo e di come i cromosomi permettono di avvicinare (e far interagire) pezzetti del genoma che si trovano lontani.

Come ha dichiarato Giacomo Cavalli, autore della ricerca e scienziato dell’Institute of Human Genetics di Montpellier:

“Concettualmente stiamo entrando in una nuova era. Quarant’anni fa guardavamo ai geni singolarmente, ora dobbiamo osservarli nel loro contesto — cioè il ripiegamento tridimensionale dei cromosomi.”

L’elisir di lunga vita

CRONACA – Il piccolo C.elegans è di nuovo sotto ai riflettori, questa volta per un nuovo studio sulla longevità. Grazie al vermiciattolo per la prima volta è stato possibile vedere che la longevità si trasmette ai discendenti anche secondo meccanismi non genetici. Una sorta di “memoria della longevità” che li porta a vivere il 30% in più dei loro simili. Come se noi invece di vivere fino a 70 anni, arrivassimo oltre ai 90!

La causa va ricercata nell’epigenetica. Ognuno di noi eredita la sequenza del DNA dai genitori, ma nel corso della vita ci possono essere modificazioni chimiche (non mutazioni) a carico delle basi del DNA che hanno un effetto sull’espressione dei geni, sulla loro accensione o spegnimento. E queste modificazioni sono in parte trasmissibili ai nostri discendenti. Per ben tre generazioni, secondo quanto riportato nella ricerca pubblicata questa settimana su Nature.

Si fa presto a dire clone

NOTIZIE – Pioppi con lo stesso DNA reagiscono diversamente alle stesse variabili ambientali, e maggiore è il tempo per cui due rami “clone” sono stati separati e sono cresciuti in luoghi diversi, maggiore è questa differenza di comportamento.

Anche nell’essere umano gemelli con un identico corredo genetico possono reagire fisiologicamente in maniera diversa a certi stessi stimoli ambientali, per esempio possono mostrare probabilità diverse di sviluppare certe malattie. Lo stesso accadrebbe anche nel mondo vegetale.

la differenza è tutta nel trascrittoma, che in qualche modo rappresenta la parte attiva del DNA di un organismo in un dato momento. Il patrimonio genetico di un organismo è uno solo, ed è contenuto nei cromosomi espressi in ogni sua cellula, in repliche sempre uguali. Individui diversi hanno patrimoni genetici diversi (a meno che non si tratti di cloni)

Cancro al seno: diagnosticarlo con l’epigenetica

SALUTE – Usando metodi dell’epigenetica, ricercatori belgi sono riusciti a identificare vari sottotipi di tumori al seno, trovando così nuovi possibili metodi per rilevare e curare la malattia. Il termine epigenetica può spaventare, ma il concetto è in realtà molto semplice: Kathleen T. Ruddy, nel suo blog sul cancro al seno, lo spiega con un’analogia culinaria.

Quanta biologia, con William e Kate!

La scienza nascosta nel “matrimonio del secolo”.

COSTUME – Come sarà vestita lei? Come sarà la torta nuziale? Quanto  spenderanno i curiosi accorsi a Londra per l’occasione? E quanti seguiranno da casa il matrimonio del secolo, in tv, su youtube o via twitter? Le nozze del principe William con Kate Middleton si avvicinano e l’entusiasmo per l’evento non risparmia neppure “Cell”, una delle più importanti riviste scientifiche del mondo, specializzata in pubblicazioni di biologia cellulare e molecolare, oncologia molecolare, biochimica e simili. Robert Kruger, uno degli editor della rivista, è riuscito a scovare un sacco di scienza anche nelle pieghe della celebrazione più mondana che c’è , firmando una piccola rassegna di temi biologici collegati (con un po’ di fantasia, ok) alla reale unione. Eccoli

Smog ed epigenetica: dove colpisce l’aria inquinata

Si cominciano a scoprire gli effetti molecolari e cellulari delle polveri sottili, con la speranza di identificare nuove strategie di protezione. OggiScienza ne parla con l’epidemiologo Andrea Baccarelli, pioniere degli studi su inquinamento atmosferico, epigenetica e salute.

SALUTE – Una dieta anti-smog. Potrebbe essere questo il punto d’arrivo di un nuovo filone di ricerca nell’ambito degli studi su inquinamento dell’aria e salute, filone che si occupa di capire quali sono gli effetti molecolari dell’aria inquinata, facendo leva sulla disciplina del momento: l’epigenetica.
In Italia abbiamo un pioniere di queste indagini: è Andrea Baccarelli, responsabile del Centro di epidemiologia molecolare e genetica del policlinico di Milano e professore associato all’Harvard School of Public Health di Boston. Un pioniere giovane (39 anni), soprattutto per gli standard italiani, che domani riceverà un premio dell’Istituto lombardo Accademia di scienze e lettere per i suoi studi su inquinamento ambientale e salute

Orizzonte epigenoma

Nasce a Parigi il consorzio per l’epigenoma umano, un progetto ambizioso da qualcuno definito “l’LHC della biologia”

NOTIZIE - Non tutto ciò che siamo è scritto nel nostro DNA. Questa certezza ha preso piede fra i biologi specialmente negli ultimi decenni: il nostro fenotipo (quello che siamo fisicamente e nelle nostre capacità, funzioni e comportamenti) anche se nella stragrande maggioranza deriva dal nostro “programma” genetico è parzialmente determinato anche dall’epigenetica e cioè le modifiche chimiche reversibili che possono o meno far in modo che i geni vengano espressi. Questo tipo di modifiche sono regolate da fattori in ultima analisi ambientali, ma possono ugualmente essere (almeno parzialmente) ereditate nelle generazioni successive. L’epigenetica negli ultimi anni è diventata un argomento di rilievo in biologia e la scorsa settimana a Parigi un nutrito manipolo di scienziati  (e istituzioni) ha lanciato l’International Human Epigenome Consortium (IHEC)